前言
年9月3日医院胡亚医院关鸿志教授团队联合在《FrontiersinMicrobiology》（IF=4.）上发表了一篇mNGS在结核性脑膜炎病原学鉴定中的可行性的研究成果，该研究结果为致残致死率高但早期诊断困难的结核性脑膜炎提供了一种新的可选择的诊断方法，作者建议mNGS值得被作为结核性脑膜炎的一线检测方法。
研究内容
研究回顾性的纳入年12月到年10月期间住院的23例明确诊断（12例）或临床诊断（11例）的结核性脑膜炎患者，比较了mNGS和结核培养、PCR、抗酸染色诊断结核性脑膜炎的检出率、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值等指标，评估了mNGS在结核性脑膜炎早期诊断中的可行性。
研究结果
01mNGS检测结果
■23例结核性脑膜炎病例中，18例（占比78.26%）脑脊液mNGS的严格对比序列比对到结核分枝杆菌，但检出的序列数均较低（见表1），比对到的序列进一步通过NT数据库的BLAST比对进行确认，结果显示和结核分枝杆菌的序列一致性均达到90%以上。
表1.mNGS阳性结果中检出结核分枝杆菌序列数情况
■病例10的mNGS结果未检出结核分枝杆菌，但检出了新生隐球菌序列条，且阿利新蓝染色和隐球菌荚膜抗原试验结果均为阳性，确认了真菌感染。然而，病人抗真菌治疗后颅高压等症状仍然不能改善，继续进行重复结核抗酸涂片检测，第八次重复结果阳性，按结核和真菌混合感染治疗患者康复。
■病例24-29在mNGS检测中被设定为阴阳性对照，mNGS检出结果与临床诊断一致（见表2），且均得到了传统方法的确认。本研究中对照样本均没有检出结核分枝杆菌序列，mNGS诊断结核的特异性达到%。
表2.mNGS检测中阴阳性对照检出情况
02
mNGS和传统方法诊断结核的性能比较
■在全部23例结核性脑膜炎病例中，各种方法检出情况如下：培养方法仅1例检出阳性（病例21）； 次抗酸染色仅检出4例阳性（18.18%），通过重复检测（病例11、12、8和10），抗酸染色的检出率增加到36.36%；PCR检出3例，分别为病例17、19和15；mNGS方法检出18例，检出率为78.26%。mNGS结合传统方法可以使检出率增加到95.65%。
表3.全部23例结核性脑膜炎病例中mNGS和传统方法的检出率比较
■在明确诊断的12例结核性脑膜炎病例中，mNGS的敏感性远高于培养（66.67%vs8.33%），也高于涂片和PCR（66.67%vs33.33%和66.67%vs25%），但没有明显差异。mNGS与抗酸染色的一致性为22.22%，与所有传统方法的一致性为44.44%。
表4.12例明确诊断的结核性脑膜炎病例中mNGS和传统方法的检测性能比较
分析讨论
■研究显示传统方法诊断结核性脑膜炎的阳性率低于40%，目前很多的治疗没有病原学依据。结核性脑膜炎的实验室检测方法各有优劣（见表5），mNGS结合传统方法提高了结核性脑膜炎诊断的阳性率，可以协助结核性脑膜炎的早期诊断。
表5.结核性脑膜炎实验室检测方法比较
■由于结核分枝杆菌为胞内菌，在脑脊液中的含量很低，且环境污染的可能性很小，因此结核分枝杆菌阈值设定应该降低，例如，本研究中有1条严格比对序列比对到结核分枝杆菌复合群即判定为阳性。
■已有的研究发现mNGS检测中很多标本中会检测到污染菌或背景菌，最常见的是痤疮 杆菌，其次是食酸菌、短波单胞菌。由于mNGS的敏感性很高，来自于环境中的、皮肤表面的、试剂中的微生物会导致污染，因此临床医生需要谨慎解读mNGS结果。
■本研究仍存在一定的局限性（见表6），因此需要更大病例数的研究进一步评估mNGS诊断结核性脑膜炎的价值。
表6.本研究的局限性
文献
文献来源：
doi：10./fmicb..
